休比爱上了美丽的母企鹅玛丽娜，而坏企鹅德雷克也觊觎着玛丽娜，于是趁着休比到海边找水晶时将他推到海里喂海豹，谁知休比却遇到了比海豹更凶狠的敌人─人类，辗转被卖到动物园；幸亏另一只企鹅洛可救了他，「两企鹅」相偕逃走，他们历经三千英哩的长途跋涉，只为了拯救休比心爱的玛丽娜，在爱情力量的鼓舞下，休比终于打败德雷克，从此和玛丽娜过着幸福的两人世界……